此外，样品采集和转移可能需要具体的标准，全自动过滤器分析前的样品完整性。样品可能需要过滤或处理，可能需要在时间内进行分析。表面上可能出现的简单过程样本收集和准备可能耗时且容易出错。例如，在分析铁时，溶解的铁需要经过过滤的样品，而对于包含未溶解的铁的总铁则需要较少的过滤。浊度，氧化铁，高铁含量和其他因素可能会干扰结果，这些加以考虑。此外，对实验室人员时间的需求严重限制了他们进行分析的频率。与分析一样，也考虑成本。为此，您增加试剂和样品制备的成本，以及收集开放式采样器的样品并将样品送到实验室的劳动力。由于实验室结果并不能实时反映过程中发生的情况，因此它们可以手动调整操作，这些调整的影响在分析下一个样本之前是未知的。

大大减少了对许多化合物进行手动取样和实验室分析的需要。今天，在许多过程中，实验室分析用于检查和验证现场分析仪，直接在过程中并且实时地进行测量。这些系统通常被称为“机柜分析仪”，它们执行与台式光谱仪相同的功能，但通常使用在特定波长下工作的光度计，因此于一个参数。这种限制将这些分析仪用于需要同时测量多种化合物的应用。对于许多化合物，发生直接的基于试剂的样品颜色反应，允许直接光度测量。然而，总磷分析仪在比色分析之前需要消化过程。